电商小店卖东西开发票的方式有商家开票，平台开票，订单开票。
商家开票：商家给平台开发票，因为平台有时候会给商家优惠补贴等；
平台开票：平台给商家开发票，因为平台会向商家收取技术服务费等；
订单开票：商家给消费者开发票。
电子发票怎么开？
1、若电商企业直接与销售商品一并收取运费，属于收取价外费用，应按13%缴纳增值税开发票。
2、电商企业能够单独成立物流公司或货运代理公司，电商企业仅代收运费，配送费发票由物流公司或者货运代理公司向消费者开具。可按“物流辅助服务”或“货运代理服务”缴纳6%的增值税开发票。
开电子发票流程
电子发票的开具流程主要有两种情况，一种是用户持有纸质凭证票据的前提下来开具电子发票另一种则是直接向商家申请开具电子发票。
一些商家会直接向用户提供可以用来开具发票的小票，可以通过微信“扫一扫”识别小票上面的二维码，根据实际情况选择个人或企业发票，
若是企业发票则需要填写详细的税号、企业名称、企业地址、银行开户地址信息信息填写完成后提交，电子发票开具成功之后就会发送至申请人预留的邮箱中。
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在购物的时候直接向商家申请开具电子发票，一般是线上购物、消费比较常用到电子发票。直接通过消费订单找到开票申请，
然后填写企业税号、名称等信息，并填写个人邮箱，发票会直接发送到邮箱中。
需要提醒的是，通过小票申请开具电子发票往往是有一定的时间限制的，一般是要在48小时内进行申请开票。
在线上申请电子发票，以淘宝购物为例就是登录淘宝账号然后选择“我的订单”，找到需要开票的订单，点击开票申请，按照页面显示填写相关信息之后就可以提交了。
电子发票是信息时代的产物，同普通发票一样，采用税务局统一发放的形式给商家使用，发票号码采用全国统一编码，采用统一防伪技术，分配给商家，在电子发票上附有电子税务局的签名机制 。
2014年3月31日，记者在现场看到，这张由乐透电子商务有限公司开出的电子发票表面外观上和普通纸质发票并无二致，包括发票代码、开票机构、金额、二维码等信息。发票开具后，则迅速生成了电子财务凭证。
"这是我国第一张具有全生命周期管理、全业务流程覆盖的电子发票，它标志着电子发票这一国家级中央部门政策性试点项目在重庆真正落地。"重庆市地税局相关负责人表示，该电子发票涉及赋码、申领、开具、存证、交换、单位归户/个人归集、核销入账，以及包括纳税人登记、申报等，是一张真正适用于电子商务发展与税收征管业务要求的(电子)发票。
重庆市地税局方面称，电子发票通过专门电子发票平台开具，买家只需勾选发票抬头，通过该平台即可获取发票。
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