谢邀
我是北航机械工程及自动化学院的学生，本科的专业是机械电子工程。我下面的回答都是按照我们学校的专业设置进行的。
按照北航机械学院的培养方案，本学院学生在大一大二和大三上学期接受的是同样的课程教学，所学的课程称为基础课和专业基础课，这部分课程主要包括：
1.工科数学分析（两学期）
2.线性代数
3.复变函数
4.概率统计
5.工程图学（两学期）
6.理论力学（两学期）
7.材料力学（两学期）
8.工程材料学
9.流体力学与液压传动
10.机械设计基础
11.制造工程基础
12.机械原理
13.机电控制工程基础
14.机电传动控制
15.测试技术基础
16.电路分析
17.模拟电路
18.数字电路
19.微机原理
上面列的这些是我们学院本科生必修课程，尤其是我加粗的几门课是机械工程的基本功，也就是说，不管你从事的是机械工程的哪个方向，这几门课你必须得吃得透透的。
另外按照我们学院的专业设置，主要分为飞行器制造、微机电系统与机器人、机械电子工程、机械设计、机械制造、工业工程、工业设计等。每个专业的本科生从大三下学期开始学习本专业的专业课。
机械电子工程的专业课有：
1.信号处理及其应用
2.机电一体化技术
3.嵌入式系统
机械设计及自动化的专业课有：
1.机械设计学
2.机械设计CAD
3.现代设计方法学
机械制造及其自动化的专业课有：
1.先进加工技术及装备
2.机械制造工艺
3.数字化制造技术
由于每个学校机械工程的专业设置不一样，所以对于你问题里的三个专业我只能比较粗浅得告诉你主要的学习内容以及研究方向。
机械电子工程主要的研究方向就是 机电一体化系统的设计以及控制；
机械设计的主要研究方向就是 机械系统的整体设计以及性能仿真、精密的传动技术等；
机械制造的主要研究方向就是 机械制造中的各种加工技术，例如精密曲面加工技术、高校数控加工技术。
总结来说就是，机电工程偏向于控制以及机电融合，机械设计偏向于机械系统的整体设计以及性能仿真，机械制造偏向于机械系统的加工成型技术。
希望我的回答对你有帮助。
